📄 infectious diseases

Estimating the strength of symptom propagation from primary-secondary case pair data

تقدم هذه الورقة منهجية قائمة على البيانات لقياس قوة انتشار الأعراض في الأمراض المعدية، حيث تُظهر من خلال بيانات اصطناعية وواقعية لمرض كوفيد-19 أن الحالات الثانوية تكون أكثر عرضة بنسبة 12-17% لتطوير أعراض إذا كانت الحالة الأولية مصابة بأعراض، مع تأكيد أن هذه التقديرات تظل قوية في مواجهة تحيزات الإبلاغ والعوامل المعتمدة على العمر.

Asplin, P., Mancy, R., Keeling, M. J., Hill, E. M.2026-04-13
📄 infectious diseases

Predictive Modelling to Differentiate Bacterial and Viral cases of Childhood Pneumonia in Kilifi, Kenya using Protein Markers and Clinical Data

وجدت دراسة أجريت على 457 طفلاً في كليفي بكينيا أن نموذجاً تنبؤياً يجمع بين مجموعة واسعة من المؤشرات الحيوية للبروتين والبيانات السريرية قد فشل في التمييز بدقة بين الالتهاب الرئوي البكتيري والفيروسي، مما أسفر عن مساحة تحت المنحنى غير كافية بلغت 0.61.

Matuli, C., Waeni, J. M., Gicheru, E. T., Sande, C. J., Gallagher, K.2026-04-13
📄 infectious diseases

A conserved grain-associated immunosuppressive niche in Sudanese patients with mycetoma.

تستخدم هذه الدراسة علم البروتينات المكاني للكشف عن أنه، بغض النظر عما إذا كان مسبب مرض المايسيتوما بكتيريًا أم فطريًا، فإن البيئة الدقيقة للأنسجة المحيطة مباشرة بحبيبات الممرض تشكل بيئة نيش (niche) محفوظة ومثبطة للمناعة تتميز بتراكم خلايا CD66b+ARG1+VISTA+، مما يسهل استمرار بقاء الممرض.

Osman, M., Ashwin, H., Calder, G., O'Toole, P., Bakhiet, S. M., Musa, A. M., Kaye, P. M., Fahal, A. H.2026-04-13
📄 infectious diseases

Classifying and Differentiating Individuals with Respiratory Syncytial Virus, Influenza, and COVID-19 Cases in OpenSAFELY

باستخدام منصة OpenSAFELY، طور الباحثون وتحققوا من صحة أنماط ظواهر حوسبية محددة وحساسة لتصنيف حالات الفيروس المخلوي التنفسي والإنفلونزا وكوفيد-19 بدقة في السجلات الصحية الإلكترونية الإنجليزية، مما أظهر توافقها مع بيانات المراقبة مع تسليط الضوء على مخاطر تباين التصنيف الخاطئ بناءً على خصوصية النمط الظاهري وعمر المريض.

Prestige, E., Warren-Gash, C., Quint, J. K., Evans, D., Costello, R. E., Mehrkar, A., Bacon, S., Goldacre, B., Barley-Mc (…)2026-04-13
📄 infectious diseases

Monitoring-based and self-reported close-contact records in relation to ultra-wideband-derived proximity in a long-term care facility: a single-facility observational study

تُظهر هذه الدراسة الرصدية أحادية المنشأة في دار رعاية طويلة الأمد في اليابان أن سجلات الاتصال المبلغ عنها ذاتياً والمستندة إلى المراقبة تُظهر أنماط تباين متميزة مقارنة ببيانات مستشعرات النطاق العريض للغاية، مما يشير إلى ضرورة تصميم استراتيجيات تحديد الاتصال لتلائم تدفقات العمل الخاصة بكل منشأة بدلاً من الاعتماد على عتبة تقارب عالمية واحدة.

Shinto, H., Chowell, G., Takayama, Y., Ohki, Y., Saito, K., Mizumoto, K.2026-04-13
📄 infectious diseases

Long COVID risk by pre-infection symptoms and functional status: A retrospective cohort study of data from the All of Us Research Program.

وجدت هذه الدراسة الاستعادية الأترابية التي أجريت على أكثر من 65,000 بالغ في الولايات المتحدة باستخدام بيانات "All of Us" أن خطر الإصابة بكوفيد طويل الأمد يرتبط ارتباطاً وثيقاً بالعوامل الديموغرافية والحالة الصحية قبل الإصابة، ولكنه لا ينجم عن مجرد وجود أعراض مسبقة أو قصور وظيفي، مما يشير إلى أن كوفيد طويل الأمد يمثل تغيراً متميزاً عن الحالة الصحية الأساسية للفرد.

Kehl-Floberg, K. E., Freisberg, E., Pop-Vicas, A., Gangnon, R., Edwards, D. F.2026-04-11
📄 infectious diseases

Decoding resistance: interpretable machine learning to predict ciprofloxacin resistance in Shigella spp

تُظهر هذه الدراسة أن نموذج تعلم آلي من نوع "الغابة العشوائية" (Random Forest) قابل للتفسير، تم تدريبه على سمات الـ "k-mer" المستمدة من بيانات تسلسل الجينوم الكامل لـ 1,424 عينة من بكتيريا الشيجلا (Shigella)، يمكنه التنبؤ بدقة وشفافية بمقاومة السيبروفلوكساسين من خلال دمج كل من الطفرات الكروموسومية والمحددات التي تتوسطها البلازميدات.

Gohari, M. R., Zhang, P., Villegas, A., Rosella, L. C., Patel, S. N., Hopkins, J. P., Duvvuri, V. R.2026-04-11
📄 infectious diseases

A Multi-Clique Network Model for Epidemic Spread with Fully Accessible Within-Group and Limited Between-Group Contacts

يقدم هذا البحث نموذج شبكة "المتعدد الكليكات" (Multi-Clique) لإثبات أن التمثيل الصريح للتفاعلات المشبعة داخل المجموعة والاتصالات المقيدة بين المجموعات يكشف عن ديناميكيات وبائية — مثل النمو الأبطأ وذروات أقل — يتم تقديرها بأقل من قيمتها بشكل منهجي بواسطة نماذج الرسوم البيانية العشوائية الكلاسيكية المتطابقة في الدرجة.

Smah, M. L., Seale, A. C., Rock, K. S.2026-04-11
📄 infectious diseases

Informing Epidemic Control Strategies: A Spatial Metapopulation Model Incorporating Recurrent Mobility, Clustering, and Group-Structured Interactions

تقدم هذه الدراسة نموذجًا مكانيًا لجمهرة فرعية من نوع (SEIR) يدمج التنقل المتكرر، والتكتل المنزلي، والتفاعلات الطبقية حسب العمر لتوضيح كيف تشكل ترابط المواقع وخصائص مسببات الأمراض ديناميكيات الوباء، مما يساهم في تحديد توقيت واستهداف التدخلات غير الصيدلانية لأمراض مثل كوفيد-19 وإيبولا.

Smah, M. L., Seale, A., Rock, K.2026-04-11
📄 infectious diseases

Adjuvanted RSVPreF3 vaccine impact over 3 RSV seasons in older adults with comorbidities

تُظهر التحليلات اللاحقة لتجربة AReSVi-006 أن جرعة واحدة من لقاح RSVPreF3 المضاف إليه مادة مساعدة توفر حماية مستدامة ضد أمراض الجهاز التنفسي السفلي المرتبطة بالفيروس المخلوي التنفسي، والمرض التنفسي الحاد، والمضاعفات على مدار ثلاثة مواسم متتالية لدى البالغين المستقرين طبياً والذين تبلغ أعمارهم 60 عاماً فما فوق ويعانون من حالات مرضية كامنة مثل مرض الانسداد الرئوي المزمن، والربو، والسكري، والسمنة.

Papi, A., Halpin, D. M. G., Feldman, R. G., Ison, M. G., Schwarz, T. F., Lee, D.-G., Incalzi, R. A., Fissette, L., Xavie (…)2026-04-11